Quando è coinvolto solo il nonno e il nipote è maschio, l’approccio migliore sarebbe quello di studiare l’aplotipo del cromosoma Y, che viene ereditato in modo identico dai genitori alla prole, tranne nel caso di mutazioni genetiche.
Pertanto, se imparentati, sia il nonno sia il nipote condividono lo stesso aplotipo del cromosoma Y.
L’aplotipo del cromosoma Y indica che entrambi i partecipanti sono imparentati attraverso la linea paterna, ma non possiamo specificare che tipo di relazione esista tra loro, cioè potrebbero essere nonni-nipoti, zii-nipoti o altre relazioni, quindi questo test è utile solo quando si sa con certezza che i possibili genitori biologici del nipote non sono imparentati tra loro attraverso la linea paterna.